جزوه تایپ شده بیوانفورماتیک
دکتر مطهره محسن پور دانشگاه پیام نور بابک باباعباسی علمی کاربردی محمد نجفی و اباذر روستا زاده میانده آزاد کاردانی کارشناسی ارشد جینمیشل
[14] [15] [16][17] [19][20]
() () [21] :
() /: -/
ً : -[22] (). – [23]
: : : (() ) [24](). ً ً ً [ چه زمانی؟ ]
[24] [24] () () ().
ً () پیش بینی عملکرد ژن ها استفاده کرد. در واقع، بیشتر روشهای پیشبینی عملکرد ژن بر روی توالیهای پروتئین تمرکز میکنند، زیرا آموزندهتر و غنیتر از ویژگیها هستند. به عنوان مثال، توزیع اسیدهای آمینه آبگریز، بخش های گذرنده در پروتئین ها را پیش بینی می کند . با این حال، پیشبینی عملکرد پروتئین میتواند از اطلاعات خارجی مانند دادههای بیان ژن (یا پروتئین)، ساختار پروتئین یا برهمکنشهای پروتئین-پروتئین نیز استفاده کند . [26]
زیست شناسی تکاملی محاسباتی
اطلاعات بیشتر: فیلوژنتیک محاسباتی
زیست شناسی تکاملی مطالعه منشا و هبوط گونه ها و جزوه بیوانفورماتیک تغییر آنها در طول زمان است. انفورماتیک به زیست شناسان تکاملی کمک کرده است و محققان را قادر می سازد تا:
ردیابی تکامل تعداد زیادی از ارگانیسمها با اندازهگیری تغییرات در DNA آنها ، نه از طریق طبقهبندی فیزیکی یا مشاهدات فیزیولوژیکی به تنهایی،
مقایسه کل ژنوم ها ، که امکان مطالعه رویدادهای تکاملی پیچیده تر، مانند تکرار [27]
[ به گفته چه کسی؟ ]
ً : ( ) [28] [29]
: : : : () /: [30]
: نقشه برداری از ژن های بیماری های پیچیده از جمله ناباروری ، [31] سرطان سینه [32] یا بیماری آلزایمر هستیم . [33] مطالعات ارتباط گسترده ژنوم یک رویکرد مفید برای مشخص کردن جهشهای مسئول چنین بیماریهای پیچیدهای است. [34] از طریق این مطالعات، هزاران نوع DNA شناسایی شده اند که با بیماری ها و ویژگی های مشابه مرتبط هستند. [35]علاوه بر این، امکان استفاده از ژن ها در پیش آگهی، تشخیص یا درمان یکی از ضروری ترین کاربردها است. بسیاری از مطالعات در مورد راههای امیدوارکننده برای انتخاب ژنهای مورد استفاده و مشکلات و مشکلات استفاده از ژنها برای پیشبینی حضور یا پیشآگهی بیماری بحث میکنند. [36]
مطالعات ارتباط ژنومی با موفقیت هزاران گونه ژنتیکی رایج را برای بیماری ها و صفات پیچیده شناسایی کرده است. با این حال، این گونه های رایج تنها بخش کوچکی از وراثت پذیری را توضیح می دهند. [37] گونههای نادر ممکن است برخی از وراثتپذیریهای گمشده را توجیه کنند. [38] مطالعات توالی یابی کل ژنوم در مقیاس بزرگ به سرعت میلیون ها ژنوم کامل را توالی یابی کرده اند و چنین مطالعاتی صدها میلیون گونه نادر را شناسایی کرده است. [39] حاشیه نویسی عملکردیپیشبینی اثر یا عملکرد یک نوع ژنتیکی و کمک به اولویتبندی انواع عملکردی نادر، و گنجاندن این حاشیهنویسیها میتواند به طور موثر قدرت ارتباط ژنتیکی تجزیه و تحلیل واریانتهای نادر را در مطالعات توالییابی کل ژنوم افزایش دهد. [40] برخی از ابزارها برای ارائه تجزیه و تحلیل تداعی انواع نادر یکپارچه برای داده های توالی یابی کل ژنوم، از جمله ادغام داده های ژنوتیپ و حاشیه نویسی های عملکردی آنها، تجزیه و تحلیل ارتباط، خلاصه نتایج و تجسم ایجاد شده اند. [41] [42]
تجزیه و تحلیل جهش در سرطان
مقاله اصلی: انکوژنومیکس
در سرطان ، ژنوم سلولهای آسیبدیده به روشهای پیچیده یا حتی () [43]
[44]
()، ()، ()، -“” () /[45] :
فهرست مطالب